Όχι, δεν εννοώ πού κάνεις save τα κομμάτια. Εννοώ πού βρίσκεται το folder όπου αποθηκεύει το cubase τα audio αρχεία των projects (τα DAWs χρησιμοποιούν ένα ξεχωριστό folder όπου αποθηκεύονται αυτά τα αρχεία). Αν δεν έχεις αλλάξει χειροκίνητα βέβαια την τοποθεσία, προφανώς είναι σε default folder το οποίο βρίσκεται στο βασικό σου partition.
Ένας από τους πολύ κοινούς λόγους για audio dropouts είναι αυτό ακριβώς. Δηλαδή στο ίδιο partition που κάνουν τα windows "δουλειά", να γίνεται και το audio processing. Θα σου πρότεινα να ψάξεις στο manual το πώς γίνεται και να αλλάξεις την τοποθεσία όπου αποθηκεύονται τα audio αρχεία. Ή αν κάποιος χρήστης cubase γνωρίζει, μπορεί να μας το γράψει εδώ.